Члены Ордена разделялись на братьев-рыцарей, приносивших три монашеских обета (целомудрия, бедности и послушания), братьев-священников и полубратьев. Членами Ордена могли стать только немецкие рыцари (чаще всего младшие сыновья феодалов, неполучившие землю) или городскии патриции. Высшим органом Ордена было ежегодное собрание высших должностных лиц - генеральный капитул. Исполнительная власть принадлежала гроссмейстеру (великому магистру) (до 40-х 13 в. - магистру), которого пожизненно избирал капитул. Если требовалось, гроссмейстера можно было снять тайным судом. Заместителем гроссмейстера был великий комтур, заведовавший хозяйством домена. Командиром войск был великий маршал.

Земля ордена делилась на баллы и комтурии, во главе которых стоял комтур. Командующий области был ландкомтур, выше него ещё стоял ландмейстер.

В Ордене также были казначеи, смотрители за госпиталем, избираемые капитулом. На должности садовников, плотников и т.д. нанимались ремесленники и рабочие. Кроме того были сёстры милосердия, а также большое количество рабов.

Орден руководствовался статутом.